Placer la biologie humaine au centre, Évolutions avec l’IA agentique, Première station OoC autonome, Organoïdes comme modèles d’interaction immunité-organe
Actus des méthodes non-animales
08 - 12 SEPTEMBRE 2025NEWS, RAPPORTS, PRISES DE POSITION
1. Le développement des médicaments : placer la biologie humaine au centre
L’industrie pharmaceutique continue de faire face à des taux d’attrition inacceptables en développement clinique. La plupart des échecs sont dus à : 1. Un manque d’efficacité : les modèles animaux ne parviennent souvent pas à saisir la véritable complexité de la biologie et de la pathologie humaines. 2. Des problèmes de sécurité, notamment ceux liés à des mécanismes spécifiques à l’humain ou à des réactions idiosyncrasiques (toxicité inattendue spécifique à l’individu). Ces deux défis reflètent in fine le même problème : la faible prévisibilité des modèles précliniques traditionnels en matière de résultats cliniques. Cette réalité impose une conclusion : nous devons placer la biologie humaine au cœur de la prise de décision. Où en sommes-nous aujourd’hui ?
Dans une récente publication sur LinkedIn, Eckhard von Keutz, ancien vice-président et responsable des sciences translationnelles chez Bayer, a lancé un appel afin de recentrer les études sur la biologie humaine, en investissant dans des plateformes adaptées à l’humain, en constituant une base de données probantes pour l’acceptation réglementaire et en favorisant une culture où la biologie humaine constitue le cadre directeur.
Lire l’appel (EN)
2. Comment l’IA transforme la science : Transition du copilote à l’agent-pilote de laboratoire
En 2025, nous sommes entré(e)s dans l’ère des systèmes multimodaux et agentiques qui écoutent, voient, parlent et agissent, orchestrant logiciels cloud et matériel de laboratoire physique avec une fluidité qui aurait semblé spéculative début 2023.
Dans une nouvelle analyse, le professeur Thomas Hartung rassemble le contenu de son livre blanc de 2024 élaboré dans le cadre du World Economic Forum Top-10-Technologies Report avec les dernières avancées jusqu’à mi-2025, allant de la synthèse documentaire automatisée et la génération d’hypothèses aux laboratoires autonomes, à l’intelligence organoïde et aux prévisions climatiques. Il soutient que la recherche entre dans une transition de l’IA comme copilote au laboratoire piloté, dans laquelle l’IA ne se contente plus d’interpréter les connaissances, mais agit de plus en plus en conséquence.
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3. L’EPA s’appuie sur l’IA pour accélérer les évaluations des produits chimiques
L’industrie chimique se plaint depuis longtemps des retards dans les processus d’évaluation, freinant l’innovation. L’agence américaine peine à respecter son délai de 180 jours pour les nouvelles évaluations chimiques prévues par le TSCA (Toxic Substances Control Act). Lee Zeldin, administrateur de l’EPA (Environmental Protection Agency), a ainsi déclaré que l’accélération des évaluations des nouveaux produits chimiques était une priorité.
Si les experts affirment que la technologie de base existe déjà, ils soulignent que l’agence se heurte encore à des obstacles importants en matière de qualité et de fiabilité des données. En effet, l’EPA envisage de développer un « assistant chimiste IA » qui « aidera les examinateurs de produits chimiques à rechercher dans divers référentiels et bases de données les informations sur les produits chimiques et leurs analogues utilisées dans les examens des soumissions TSCA et les évaluations de risque, ce qui pourrait permettre d’économiser des centaines d’heures de travail par examen/évaluation ».
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4. ISTAND devient un programme de qualification permanent
La Food and Drug Administration (FDA) américaine reconnaît l’importance du développement de médicaments innovants pour accélérer la mise à disposition de nouveaux traitements aux patient(e)s et aux consommateur(rice)s. C’est pourquoi la FDA a annoncé la transformation de son programme pilote ISTAND (Innovative Science and Technology Approaches for New Drugs) en un programme permanent de qualification des outils de développement de médicaments (DDT pour Drug Development Tool). Lancé en 2020, ISTAND continuera de soutenir les approches innovantes et scientifiques qui améliorent le développement des médicaments et la prise de décision réglementaire, contribuant ainsi à la mise à disposition de thérapies répondant aux besoins non satisfaits des patient(e)s.
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INTERVIEWS, NOMINATIONS, RÉCOMPENSES
5. Hans Clevers revient à l’Institut Hubrecht
Hans Clevers, ancien directeur et chef de groupe de l’Institut Hubrecht, est de retour à l’Institut Hubrecht depuis le 1er septembre. Il dirigera le groupe Organoïdes, désormais Clevers Group, et portera le titre de chef d’équipe distingué, en reconnaissance de ses contributions exceptionnelles à l’Institut, en tant qu’ancien directeur, et pour l’impact qu’il a eu sur l’Institut et la société grâce à ses découvertes scientifiques révolutionnaires.
Hans Clevers avait quitté l’Institut Hubrecht en 2022 pour devenir responsable de la recherche pharmaceutique et du développement précoce chez Roche à Bâle, en Suisse. Chez Roche, il a été l’un des principaux artisans de la fondation de l’Institut de biologie humaine (IHB), dont il assure actuellement la direction par intérim.
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6. Nicole Kleinstreuer reçoit le Humane Science Innovator Award 2025
Dr Nicole Kleinstreuer, directrice adjointe par intérim de la coordination des programmes, de la planification et des initiatives stratégiques des National Institutes of Health (NIH), a reçu le Humane Science Innovator Award 2025. La cérémonie de remise des prix s’est tenue lors du WC13 Rio — World Congress on Alternatives and Animal Use in the Life Sciences, au Brésil.
Nicole Kleinstreuer a été choisie pour recevoir le prix de cette année en raison de son leadership et de ses efforts dynamiques, au sein des NIH et à l’international, pour promouvoir le développement et l’adoption de méthodes sans animaux. Son expérience en génie biomédical, en mathématiques appliquées et en bio-ingénierie lui a permis d’appliquer la modélisation informatique, l’intelligence artificielle et la toxicologie de pointe à la science réglementaire, sans animaux.
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OUTILS, PLATEFORMES, APPELS
7. TOXTRUST : Pour une intégration robuste des résultats des NAM dans la prise de décision
Dans la recherche d’alternatives aux études in vivo, l’application de cadres d’évaluation impliquant des Nouvelles Approches Méthodologiques (NAM) conduit souvent à la disponibilité simultanée de multiples éléments de preuve de qualité variable. Si ces éléments ne sont pas intégrés correctement, un ensemble de résultats issus des NAM peut produire des résultats trompeurs qui compliquent le processus d’évaluation ou conduisent à des conclusions erronées.
Pour favoriser une prise de décision transparente lorsque plusieurs NAM sont appliquées pour générer des résultats sur la même question toxicologique, Karolina Kopańska et al. ont développé TOXTRUST, un outil informatique open source intégrant le cadre mathématique de la théorie de Dempster-Shafer (DST). Dans un article récent, les chercheur(e)s illustrent comment TOXTRUST peut être appliqué à tout critère d’évaluation avec des résultats finaux binaires, en mettant l’accent sur la génération et l’interprétation de résultats exprimés par des bornes de probabilité.
Lire la publication dans le NAM Journal (EN)
INDUSTRIES, BIOTECHS, PARTENARIATS
8. Comment AVA Emulation System permet d’obtenir des données pertinentes pour l’humain
Le processus de découverte de médicaments est à la croisée des chemins. Alors que près de 90 % des candidats aux essais cliniques n’obtiennent pas l’approbation de la FDA, le besoin de modèles plus prédictifs et pertinents pour l’humain n’a jamais été aussi grand. C’est pourquoi Emulate a récemment lancé le système d’émulation AVA™, la première station de travail autonome de type Organ-on-a-Chip, conçue pour offrir évolutivité, reproductibilité et accessibilité à cette technologie transformatrice.
Jim Corbett, PDG d’Emulate, apporte un point de vue unique sur la manière dont AVA va accélérer l’adoption dans les secteurs pharmaceutique, biotechnologique et universitaire, et pourquoi il représente un tournant pour la découverte de médicaments pertinents pour l’humain.
En savoir plus sur AVA Emulation System (EN)
DÉCOUVERTES SCIENTIFIQUES & PROTOCOLES
9. Des modèles 3D ajustables pour des immunothérapies plus efficaces
Dans les immunothérapies (ICT pour Immune Cell Therapies), des cellules immunitaires sont prélevées sur des patient(e)s, puis modifiées et amplifiées in vitro. Elles agissent comme des « médicaments vivants » qui reconnaissent et réagissent aux états pathologiques lorsqu’elles sont réinjectées aux patient(e)s. De nombreuses thérapies cellulaires avec les T‑Cells modifiées ont été approuvées pour le traitement des cancers hématologiques. Deux des principaux objectifs des développeurs d’ICT, la spécificité des cellules cibles et la sécurité, sont de mieux en mieux pris en compte grâce aux progrès de l’ingénierie des cellules immunitaires et du génome. Cependant, un troisième objectif, maintenir l’efficacité thérapeutique des cellules immunitaires, d’abord pendant leur amplification in vitro (fabrication) puis après leur transfert aux patients, reste un défi de taille.
Une équipe dirigée par David Mooney de l’Institut Wyss a développé un nouveau système de biomatériaux ajustables qui permet aux chercheur(e)s d’étudier et d’exploiter les effets de la mécanique tissulaire sur l’état des cellules T thérapeutiques in vitro. Le système est un modèle 3D conçu avec de la matrice extracellulaire — de type gel — produite par les cellules, qui est responsable des différentes « rigidités » et « viscoélasticités » des tissus et permet de réguler ces deux paramètres indépendamment.
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10. Caractérisation des tumeurs colorectales avec les méthodes multi-omique mononucléaire et PDOs
Le cancer colorectal (CRC pour Colorectal cancer) se développe dans le tissu colorectal, sous l’effet d’une maladie génétique ou de l’accumulation de mutations somatiques, entraînant une croissance anormale des cellules épithéliales. Dans une étude récente, le Dr Zhijun Yu et son équipe du Prinses Maxima Centrum ont utilisé l’approche multi-omique mononucléaire sur plus de 100 000 noyaux cellulaires de haute qualité pour étudier le paysage moléculaire des tissus primaires et des organoïdes dérivés de patients (PDO pour Patient-Derived Organoids).
Leur analyse a montré que les PDO normaux dérivés de tissus adjacents aux tumeurs reproduisent la composition cellulaire et la trajectoire de différenciation des cryptes colorectales. L’étude offre une vue d’ensemble de la transition de l’épithélium colorectal normal à l’épithélium malin et souligne l’utilité des PDO comme modèle fiable pour capturer les caractéristiques conservées et spécifiques des patient(e)s atteint(e)s d’un cancer colorectal.
Lire l’article publié dans l’International Journal of Cancer (EN)
11. Les organoïdes comme modèles d’interactions immunité-organe
L’intégration de cellules immunitaires dans les organoïdes permet d’explorer des aspects jusqu’alors inaccessibles des interactions entre cellules immunitaires et épithéliales in vitro. Dans cette revue, Nikolche Gjorevski et al. ont expliqué comment l’intégration de cellules immunitaires dans des systèmes organoïdes permet de modéliser les réponses immunitaires fonctionnelles à l’échelle organique, mais aussi d’étudier certains aspects des maladies inflammatoires et du cancer.
Après avoir détaillé comment les co-cultures cellules immunitaires-organoïdes peuvent modéliser l’immunité muqueuse à chaque étape d’une réponse inflammatoire fonctionnelle, les chercheur(e)s ont ensuite décrit comment les systèmes organoïdes inflammatoires ont permis de mieux comprendre les caractéristiques à l’origine du stress chronique et du remodelage dans les maladies auto-immunes, et ont exploré comment les organoïdes de carcinomes dérivés de patient(e)s peuvent être combinés à des compartiments immunitaires pertinents pour la tumeur pour la recherche en oncologie. Cette revue a souligné les principaux défis actuels et l’ambition ultime de développer des systèmes où la dynamique homéostatique est établie, maintenue et perturbée à un état différencié pleinement mature et où la mémoire immunitaire peut être acquise de novo face aux défis pathogènes.
Lire la revue complète dans Cell Reports (EN)
A NE PAS MANQUER
Ombion Centre for Animal-free Biomedical Translation Survey (date limite : 31 oct.)
